凡对抗体无毒性又具有高催化效率的酶，理论上均可标记抗体。但免疫酶组织化学技术要求酶与底物作用生成的有色产物能在光镜及电镜下观察到，所以这些产物必须具备两个条件：*，产物必须是不透光或不透电子的，否则不能被光镜及电镜观察到；第二，产物必须是不溶解的，否则产物将发生扩散，影响其准确定位。而理想的酶也应尽可能符合下列标准：

①性质稳定，活性高；
②该酶较易获得纯制品，而且纯度要很高；
③酶与免疫球蛋白等物质结合时不丧失其活性；
④酶反应产物必须稳定，不应发生扩散，影响组织学定位；
⑤酶相应底物易于保存、制备；
⑥被检组织中没有与底物有关的酶作为内源性组分存在。

*具备上述条件的酶并不多见，目前常用于标记的酶有辣根过氧化物酶（horseradish peroxidase，HRP）、碱性磷酸酶（alkaline phosphatase，AKP）、酸性磷酸酶、葡萄糖氧化酶（glucoseoxdase，GOD）、b-半乳糖苷酶、葡萄糖淀粉酶、乙酰胆碱酯酶等。其中辣根过化物酶、碱性磷酸酶、葡萄糖氧化酶应用比较广泛，且绝大部分免疫酶组织化学技术使用HRP酶是一种*的蛋白质催化活性物质，现代技术已可生产100％纯的酶，如HRP和AKP等，它们的催化效率非常高，

分子高纯度酶在lmin内可催化10000～1000000分子的底物。酶的活性高低将依赖于下列几种可变参数：
①酶和底的浓度；
②缓冲液的pH值和盐的浓度；
③温度和光线。