一、培训班上课内容
上课内容涵盖“基因组学―蛋白质组学―系统生物学”的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。
核心课程包括：
1. 基因组的比较研究、DNA测序技术原理与进展（讲课人：于 军 教授）
2. 转录组的测定与分析、大规模测序方法及应用、微生物基因组学、基因组学与医学（讲课人：胡松年教授）
3. 系统生物学建模分析及高通量分析技术应用（讲课人：杨军、陈铭教授等）
4. 蛋白质组学概论及应用 （讲课人：钟伯雄教授）
二、培训班上机内容
上机实习课采用 “跟我学”方式，学习实践各类基础生物信息学软件，每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。
主要内容如下：
实习一： 基因组数据注释和功能分析
通过序列比对工具BLAST的学习，了解基因功能注释的原理；介绍多序列联配工具ClustalX及分子进化分析软件MEGA4，掌握系统发生树绘制的基本方法，认识基因复制在进化上的功能；学习基因序列分析常用的数据库和软件。
实习二： 转录组数据分析
介绍转录组数据分析的基本流程及其原理；通过对tophat、cufflinks、R等转录组数据分析工具的介绍及演示，了解基于二代测序数据的转录组分析流程及常用分析方法； 利用kegg、GOstat、DAVID等在线工具挖掘转录组数据的生物学意义。
实习三：系统生物学软件实习-----网络结构显示与分析
利用Cytoscape系统生物学分析软件，分析蛋白－蛋白相互作用，展示分子网络系统，并与基因表达等数据整合。
实习四：蛋白质结构与功能分析
从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始，接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析，预测目标蛋白的生物功能。
实习五： 蛋白质组质谱分析
使用X！Tandem、Mascot、Sequest等软件鉴定蛋白质质谱数据，将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白；使用TPP软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。
三、培训对象
无生物信息学背景，希望了解生物信息学的学员；
计划开展各类组学研究的科研人员；
已有组学数据需了解分析方法的研究人员；
有志从事生物信息学相关工作的学生或者技术人员。
